btw: ich weiß auch nicht, warum immer alle verlangen, sofort das allerbeste System zu haben.. Ich habe auch relativ lange mit einem Standard-PHPMyAdmin gearbeitet (also nur DB eingetragen, damals gab es auch nicht allzu viel mehr Optionen

) und erst vor ca. einem halben Jahr immer mehr Optionen ausgetestet..
Wer sofort das beste System haben will, hat meiner Ansicht nach das Problem, dass er nie einsteigen wird, da das System einfach viel zu komplex ist..
So habe ich auch vor kurzem meine Mailserver-Config gemacht (Exim).. Erstmal schön simpel, so dass man die Grundsätze versteht.. Wenn ich gleich am Anfang MySQL-basierte Config kopiert hätte, würde ich wahrscheinlich heute noch nicht so durch das System durchschauen..
aber zurück zu PHPMyAdmin:
PDF ist imho idiotisch - es gibt besseres (Visio usw..)
Relation ist nur ein nettes Feature
PersistentConnections sind ok, falls nur wenige damit arbeiten
ExecTimeLimit auf 0 wenn du große Dumps verwenden willst
LeftDisplayLogo auf false - wer braucht schon das Logo
ShowMysql-Info/-Vars - nur sinnvoll wenn man weiß was es bedeutet
*ZipDump - aber immer doch :-D
DefaultTabDatabase/DefaultTabTable - musst du selber entscheiden
SQLValidator - na ja, funktioniert AFAIK nicht richtig