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Ein bisschen mehr Info wäre hilfreich.
Da das ganze periodisch auftritt und zwar nachts, würde ich mal auf cron.daily tippen. Schau doch mal, was da so jede Nacht läuft.
Kandidaten wären z.B. makewhatis und updatedb (locate) oder ein Virenscan o.ä. Mit der Grafik allein und ohne weitere Info lässt sich das aber nicht näher ergründen.

Hehe, die Grafik sieht ja dramatisch aus, aber steht 300 m an der Y-Achse nicht evtl. für 0,3 ? Das Maximum in der Legende zeigt ja, dass der Rechner nie was zu tuen hat.

hehe, ist mir auch nicht aufgefallen. 0,3 ist ja gar nichts. Solange der Wert nicht dauerhaft auf >1 oder in längeren Spitzen >3-5 steigt, ist das eigentlich noch kein Grund, sich gedanken zu machen.